Laboratorium merupakan tempat dilakukannya riset ilmiah, eksperimen, pengukuran ataupun pelatihan ilmiah. Laboratorium biasanya dibuat untuk memungkinkan dilakukannya kegiatan-kegiatan tersebut secara terkendali.

Pada dasarnya Program Magister Pertaniann Tropika Basah mengikuti atau memakai fasilitas yang dimiliki oleh Fakultas Pertanian yaitu 22 laboratorium yang digunakan untuk melaksanakan penelitian dan praktikum untuk mahasiswa fakultas pertanian, serta 1 (satu) fasilitas fakultas pertanian yaitu Kebun Percobaan yang digunakan sebagai sarana pendukung penelitian dan praktikum lapangan.

Laboratorium yang ada dilingkungan Fakultas Pertanian adalah sebagai berikut :

Laboratorium dari Jurusan Agroekoteknologi:

1. Laboratorium Agronomi
2. Laboratorium Bioteknologi
3. Laboratorium Hama & Penyakit Tumbuhan
4. Laboratorium Ilmu Tanah
5. Laboratorium Kartografi & SIG (Informasi Lebih Lanjut dapat mengakses Blog Laboratorium Kartografi & SIG)
6. Laboratorium Kultur Jaringan
7. Rumah Kaca & Para-Para

Laboratorium dari Jurusan Agribisnis:

1. Laboratorium Manajemen Agribisnis
2. Laboratorium Ilmu Komunikasi dan Penyuluhan Masyarakat

Laboratorium dari Jurusan Teknologi Hasil Pertanian:

1. Laboratorium Kimia dan Biokimia Hasil Pertanian
2. Laboratorium Mikrobiologi Hasil Pertanian
3. Laboratorium Pasca Panen dan Pengemasan Hasil Pertanian
4. Laboratorium Pengolahan dan Pengawasan Mutu Hasil Pertanian

Laboratorium dari Jurusan Peternakan:

1. Laboratorium Nutrisi Ternak
2. Laboratorium Produksi dan Teknologi Peternakan